北京市眼科研究所和北京市耳鼻咽喉科研究所，与医院主体并称“一体两翼”，成为集医疗、教学、科研、预防、国际交流五位一体的医疗科研联合体。眼科、耳鼻咽喉科为原卫生部批准的国家临床重点专科，变态反应科为国家卫生和计划生育委员会批准的国家临床重点专科，中医眼科学为国家中医药管理局批准的国家级中医重点学科。首都医科大学北京眼科学院和耳鼻咽喉科学院设在院内。医院设有世界卫生组织防盲合作中心和世界卫生组织防聋合作中心，附设北京同仁眼库(国际眼库协会会员)。

　　同仁医院现有中国工程院院士1人，北京学者2人，长江学者1人，享受国务院政府特殊津贴专家10名，获国家级、北京市突出贡献专家8人。作为首都医科大学第四临床医学院，医院承担着重要的教学任务。医院现有学位点28个，其中博士学位点13个。硕士生导师107人，博士生导师37人。拥有15个北京市住院医师培训基地。

　　改革开放以来，医院共获得省部级以上科技成果奖励135项，其中国家级8项，获得国家自然科学基金资助项目238项。

　　同仁医院历经百余年发展凝练出“精诚勤和”的医院精神。在新的历史时期，同仁人将继承和发扬百年同仁优良传统，弘扬主流文化，苦练内功，精于内涵，团结一致，创新发展，努力为人民群众提供优质、高效、快捷的医疗服务。